平成年間，東京都。

　　米花區縣的區立高中，高二年級B班。有一個智商超高，情商有點低的超級大偵探，叫工藤新一。

　　今天，是開學的第一天。他得和自己的青梅竹馬毛利蘭一起，走路去帝丹高中上課。

　　“洗衣機！我聽園子說，今天會來一位新的生物老師…”蘭在后面追新一，邊走邊說。

　　“終于擺脫了，那個啰嗦老太婆嗎？還真是大喜訊啊！”新一絲毫沒有意識道，接下來的展開方式，臉上還洋洋得意的露出了笑容。

　　另一邊，宮野學閥宅邸，宮野艾蓮娜叫醒了自己的小女兒，宮野志保。

　　今天是她從米國回來之后，第一次必須出去的日子。

　　因為，宮野志保投了簡歷到帝丹高中，并且被通過了。她現在主教生物，是新上任的生物老師。主教帝丹高二年級，工藤新一在被教導的范圍之內。

　　這便是，緣分之始。