南劍門。

　　主角慕千云，一覺醒來找師傅撒嬌，突然弟子匯報天門從后山來攻，師傅和大師兄傲霜帶領弟子前往后山御敵。

　　慕千云出門碰見幾個雜兵從后山溜了進來，被主角解決了，打斗下觸動了密室開關，主角獲得通天玉的認可。

　　隨后慕千云趕去支源師傅和大師兄，到山門遇見了大師兄，得知師傅正在和絕天決斗，于是上線和大師兄一起對敵和尚尤彌爾和烏龜大師。

　　絕天與師傅打的難舍難分，最終互相受了重傷，被迫退走。

　　此一戰后，師傅重傷閉關，慕千云告訴了師傅通天玉的事，大師兄也在一旁。師傅認為玉已認主，便讓慕千云好好收著。

　　隨后大師兄傲霜告訴慕千云，有一種名叫靈珠的寶物可以治好師傅的傷，慕千云救師心切，遂打算下山尋藥。

　　途中突然出現天門賊人，幸好傲霜及時趕到，拖延住了他們，并告訴慕千云從東邊渡口趕緊離開，他隨后會找慕千云匯合。

　　慕千云到了渡口，沒想到突然跳出來一個和尚沙彌爾，慕千云拼死也不是對手，被擊敗了。

　　？？：慕千云

　　？？：慕千云

　　慕千云：誰？

　　慕千云：誰在喊我？

　　周圍一片黑暗

　　慕千云：我死了嗎？

　　慕千云醒了過來，發現自己被關在地牢里，千辛萬苦終于闖出第一道迷宮，第二道迷宮被守衛尹留發現，又是一場惡戰，最終慕千云得勝，逃離了地牢。

　　來到傲劍山莊，正在開比武大會，沒想到絕天帶領小弟找到了慕千云，很多武林高手挑釁絕天都被秒了，最后絕天想要抓走慕千云。

　　才一個回合主角就被秒。

　　突然通天玉發出一陣白光，裹挾著慕千云消失不見，等他再醒來時已經到了一個叫子幽谷的地方，被一個叫龍雨姍女孩救了。

　　在得知了這個村子的情況后，主角選擇在這里養傷……十天后，傷也養的差不多了，去找雨姍一起下山采藥吧。來到子幽谷右邊的二哥屋內，發現雨姍正與二哥交談，上前得知，二哥的病又犯了，雨姍正要說出此病的救治方法時，卻被二哥訓斥，雨姍傷心的跑了出去。出門后，上前和雨姍交談，得知二哥之前被蜘蛛怪物所咬，沒有來的及醫治才落下病根，并知道紫峰山所住神醫，只有他才有可能醫治此病。交談間，幾個山賊突然闖入，戰勝后，向紫峰山出發吧。

　　出了子幽谷，往下走，便能看到紫峰山。在半山腰處看到了前面幾個在幽谷打劫的山賊，原來他們回到此處來尋求他們大哥的幫助。沒什么好說的，再次解決他們！來到深處的房屋處，遇見了當年咬傷雨姍二哥的蜘蛛怪，擊敗它后神醫出現，原來這只怪物是神醫所養，用來做醫學研究。對話后，神醫決定出手相助。可是，想要得到解藥，還需要得到“九宮草”和“活誕草”。往右走，來到百草園，分別在兩處獲得了這兩種藥草。（地圖的左上角和右上角）之后在神醫的幫助下獲得了醫治二哥的解藥。

　　回到子幽谷，發現二哥被殺，雖然讓人悲傷，可小弟龍月和大伯的下落還不知道，二人決定去附近的滄州城尋找線索。

　　滄州城，交談中，一個村名突然說出了一個線索，幾個月前天門的人曾經帶著一老一小經過這里，走了這么久，終于找到一個有用的線索了。

　　從岸邊出來后，往東走進入百鬼洞窟，又是一個迷宮，走到盡頭處，發現被天門抓到這里的正是小弟龍月和大伯，擊敗天門眾人后，出現一位神秘人士，原來他就是二十年前和尹燕南齊名于江湖的大俠方孤鴻，從他那得知了天門的真正目的，需要用“通天玉”來完成“人魔共通”的實驗，只有打敗他，江湖才能獲得真正的安寧。

　　救出了大伯和小弟龍月，在東渝村分別。

　　于是主角打算歷練后找絕天算賬。

　　終于找到了無心崖，見到了大師兄傲霜，慕千云激動不已，問師兄是不是來和自己共同對戰絕天的，結果傲霜露出了自己的真面目，不再偽裝，他是和天門一伙的，來這里是為了殺慕千云得到通天玉。

　　慕千云聽聞后難以置信，大師兄竟然是叛徒，于是含淚和他捉對廝殺，最終傲霜死在慕千云的劍下。

　　慕千云已經悲傷且憤怒到了極致，接著就上天門算賬去了，一路清理雜兵，終于見到了絕天。

　　絕天哈哈大笑，認為正中下懷，于是開打，主角帶著龍雨珊VS絕天和他的兩個小弟尤彌爾和烏龜大師。

　　（特殊關一葉障目無效）

　　主角慘勝，帶著龍雨珊回了南劍門，所謂的仙藥靈珠其實是假的，慕千云以通天玉給師傅療好了傷。最終慕千云與龍雨姍相忘江湖。