接下來的劇情本應該是在東西海交鋒之后，凱多對商島展開報復行動，大媽坐守新世界，克里斯被迫暴露了商盟的存在，并擊退凱多，不過成員的巴基（駐地，參與防守）、克洛克達爾（不在）、莫利亞（復仇）、伽治（不在）、艾尼路（不在）都沒有暴露，其余成員全部顯露，引得一定忌憚，但是也讓世界政府舒心了一些，畢竟他們以為看透了。
同時新海軍對大媽發動進攻，黑胡子趁機入局，掠奪走了大量人造惡魔果實，以及科學家凱撒，卡塔庫栗在克里斯的話語中產生動搖，開始想辦法如何針對修女，在這個時間里黑桃海賊團橫掃白胡子地盤，與白胡子二世分庭抗禮。
迷路艾尼路在旅途之中莫名其妙對了一批信徒，就很怪。
伽治來到南海，開始新的生物研究。
等到戰事平息，世界政府的威懾力再度下降，而新海軍與商盟則是名聲大噪，世界暫時歸于平靜。
隨后的事件便是北海謝爾德偵破天王秘密，那是一個有所損壞的衛星軌道炮，操作權在五老星手上，不過五老星擔心使用過后過載，這才遲遲未用。
古代武器冥王則是屬于阿托斯羅家族，也就是三桅帆船的核心武器，曾在滅國前移交給了一位船匠，最后毀于弗蘭奇之手。
海王是就人類為了能在以后迎敵元素與惡魔的入侵，做出適應性的進化，沒成想被天龍人截胡，成了低階生物。
梵岡被迫撤出紅土大陸，回到宗教總部進行修養，同時著手培養自己的特殊行動部隊，準備下一次的反攻計劃。
基德入侵南海，救出了已經與暴君無異的兄弟回到了西海，卻被皇帝凱撒看破，在病毒肆意前，成功隔離開來，幸運的是，基德本人并沒有被感染，從此基德與BOWY公司不共戴天。
本因各地勢力的崛起而降低海賊出現的這個時期，紅伯爵橫空出世，并快速的集結了一批惡徒，于樂園區域擴展地盤。
紅發海賊團放棄斡旋的想法，有些擺爛性質的玩樂起來，而好戰的巴雷特在膽小鬼的勸說，靜靜等待格局的變化，泰佐洛成功找到了獵殺小隊，與之展開了合作，黑市蘇楚再次活躍，與摩根斯和紅伯爵開展結盟性質的合作，世界格局逐漸從紛亂化作群雄。
隨著草帽小子海賊團出現，世界隱隱約約中再起波瀾，并且在機緣巧合下，他們進入和之國，與其勢力展開斗爭，獵殺小隊出現，并提前結束了堪十郎的生命，收獲畫畫果實。
面對即將完蛋的凱多與大媽，新海軍與海軍同時出手，準備一網打盡，卻被圖謀歷史本文的史基與調和的紅發海賊團破壞，雖然捕獲了凱多與大媽，但是其干部幾乎脫逃，除了以卡塔庫栗為首的暫時保住大媽海賊團的名號，百獸海賊團徹底被史基吸收，引起世界政府的強烈忌憚，而草帽大船團也與此成立，白胡子二世獲得震震果實。
隨著梵岡再次現身紅土大陸，世界政府與天龍人不再忍讓，調動了大部分陸軍與情報人員對西海發動攻擊，同時調動天王攻擊東海，一世君主太一殞命，而他的遺言并沒有將位置并傳給自己的兒子或者大臣，而是給予了辛塔姆的考特，商盟看在佛耶戈的面子上，下手協助站臺，第二發帶走了教廷算是報復。
然而這本該極具威懾力的行為卻被謝爾德發現，武器天王徹底損毀，港口黑手黨全軍出動施壓紅土大陸，數道屠魔令發出，幾乎將海軍百分之八十的戰力掏空，赤犬當場高血壓。
不過這批成員之中出現了一個變數，那就是明哥，他感覺時機已經到了，在戰斗不但劃水，還用能力拖后腿。
BOWY公司見勢不對，下場調控，對他而言，動蕩是好，但是失衡就不行了，展現真正實力的公司，快速壓制住了革命軍，并且調出生化武器援助梵岡的侵襲，獲得時間的世界政府全力向西海發動剿滅戰。
商盟明白如果四海議會破裂，那么天龍人可能重新拿回主權，不再保持中立，以足夠利益催動商盟成員介入戰斗，這時，七武海名存實亡。
在這個時間點上，黑胡子、史基、路飛三人繼續角逐大秘寶，新海軍介入其中。
巴雷特海賊團向世界政府發動進攻，紅發繼續開擺，因為此時的世界已經無法調控，在天王的失效起，已經徹底失控。
五老星不在懸坐高臺，親自下場，而這一切已被蘇楚洞穿，紅伯爵、獵、泰佐洛、艾尼路、阿土、黑白、計然出現，與其展開交鋒。
隨著北海戰線的率先崩潰，港口黑手黨壓入紅土大陸，明白事情嚴重性的赤犬這才全力馳援陸軍，不過無法理解的地方是，世界政府依然沒有撤回西海遠征軍。
梵岡擊退生化武器，殺到三大圣城前明白了世界政府的用意，就連五老星的出動也只是為了逼迫暗處的勢力，因為三處圣城都由能量罩保護，并且都配備了冥王武器，只是五老星們沒想到，他們一時之間都脫不了身罷了。
BOWY公司也正是明白了這點后，開始龜縮起來，就連阿弗萊斯也是被騙出了部分實力。
但是苦苦支撐的西海千帆帝國終歸敗退，三將十三王全數戰死，重整旗鼓的東海東帝國協同革命軍遠征天龍人，商盟接手西海戰場，與世界政府全面交鋒。
巴雷特筆直向著圣地瑪麗喬亞行進，徹底打破五老星的僵局，五位老者三死一擒一逃，預示著玩漏的開端。
北海海軍的敗退悉數退守到了紅土大陸，其中有著天龍人血脈的明哥通過撤退時的英勇表現，得到了天龍人的特赦，而這一赦，直接導致三城之一的一城失陷，由赤犬率領核心海軍們其中不少站到了明哥身邊，他們早已看不慣天龍人，此時他們不介意將那些家伙踢下歷史舞臺，這份背叛，赤犬絕不接受，一場內耗在紅土大陸上展開，最終在己方勢力到場下，赤犬一方落敗，黃猿、青雉表示退出這場戰爭。
北海、革命軍、教堂、東國四方匯合，殺向第二座圣城。
新世界此時也打的天昏地暗，物理性質上，不過隨著黑桃海賊團的加入，本就搖搖欲墜的黑胡子海賊團徹底崩塌，紅發似乎也在想清楚后，決定助力路飛，雖然歷史的真相已經不算重要了，但是該讓世界知道的，還是要去做，并且搬出海賊法典，使得史基、草帽小子、黑桃海賊團、黑胡子海賊團之間的混戰宣布暫時結束，擊退了新海軍的圍剿，而而黑胡子海賊團順勢逃走，退出了爭斗，艾斯則是告別了路飛，繼續追擊黑胡子，路飛的草帽大船團在紅發的見證下與史基展開了殊死決斗。
紅土大陸這邊，謝爾德改造出載體，使冥王大炮可以移動，成功轟開第二個圣城的防護，激烈的戰斗中，兩個冥王皆被破壞，謝爾德雖然結構了冥王，但是短時間內并無相應生產鏈，進攻進入的停滯階段。
與此同時，新世界這邊打出結果，摩根斯全程關注，并跟隨路飛前往旅途的終點，紅發知道，但并沒有阻止其尾隨，最終路飛獲悉真正的歷史，并通過摩根斯向世界宣告。
西海商盟打敗了世界政府的主力部隊，并成功聯系到了白白海之上的元素領主爆炎與大地，二者聯合擊碎了最后的圣城，至此商盟宣布退出戰爭回到中立，至于天龍人，他們最終化作了歷史。
眼瞅著自己可能被圍剿的阿弗萊斯啟動最終預案，釋放高傳染生化病毒，自己將基地沉入大海，然而沒人想到，隨著三座圣城的失守，空間開始出現裂痕，并且一股莫名的氣息也在這道空間裂隙下飛速靠近，似乎不止一場危機在向這個世界襲來。
完結。