故事劇情連接第五部結尾，會加入大量傳說的寶可夢和大量mega進化。翻譯方面主要采用官譯（即將神奇寶貝、寵物小精靈、口袋妖怪通通譯為精靈寶可夢，精靈和技能名稱采用官譯為主，有時如果記不起來有官譯的可能會采用民間翻譯）。

　　各地反派會復活，同時操控各種傳說的寶可夢。劇場版采用“部分平行”（即部分劇場版與小說為平行關系，少數劇場版與小說同線）。

　　結局方面采用“多分支結局”（即智霞結局、智遙結局、智光結局、智艾結局、智瑟結局、后宮結局，后宮結局除女主外還有如莉拉、科爾尼等）。