涼宮春日的憂郁2009版是小說 《涼宮春日的孤獨》 和 《涼宮春日的哀鳴》 的重制版內容與原作基本保持一致但進行了一些刪減和改編。
其中 《涼宮春日的孤獨》 收錄了小說的前四卷包括 《涼宮春日的憂郁》 、 《涼宮春日的消失》 、 《涼宮春日的驚異夜話》 和 《涼宮春日的無聊世界》 等內容。
而 《涼宮春日的哀鳴》 則收錄了小說的第五卷和第六卷包括 《涼宮春日的哀鳴》 、 《涼宮春日的驚異夜話》 和 《春日的哀思》 等內容。
除此之外2009版還收錄了一些特別篇和番外篇如 《涼宮春日的冒險》 、 《涼宮春日的魔法島》 和 《春日的巧克力》 等。